肿瘤标志物是指用免疫法、生物化学方法检测的能够区分肿瘤和非肿瘤的物质，包括肿瘤抗原、糖蛋白、激素、酶与同工酶、癌基因和抗癌基因等。随着现代分子生物学飞速发展，肿瘤标志物越来越多，为肿瘤的早期筛查和早期诊断带来了新的发展机遇。目前肿瘤标志物广泛用于临床肿瘤筛查、术前评估、术后随访、预后判断等领域。但也存在着一定局限性，比如目前常用的肿瘤标志物既存在于肿瘤中，也可以存在于正常人或慢性炎症病人的血液和体液中，因此在诊断肿瘤时特异性和灵敏度尚不高，仅能用于肿瘤的辅助诊断，不能仅凭超过正常上限参考值就做出诊断。

消化道肿瘤病人临床常用的肿瘤标志物有癌胚抗原（CEA），糖蛋白类如AFP，CA72-4，CA19-9，CA242等。如AFP（甲胎蛋白）可辅助原发性肝癌的诊断，而且还是胃癌病人的独立预后因子，可以帮助判断是否存在肝转移。CEA是个广谱肿瘤标志物，可用于胃癌、结直肠癌、胰腺癌等多种消化道肿瘤的辅助诊断，也可用来帮助判断术后复发转移；有研究证实CA72-4在胃癌、结直肠癌检测中的敏感性高于CEA、CA19-9。如果能够联合检测上述多种肿瘤标志物会提高阳性率，临床参考价值更高。