作为卵巢癌重要的相关抗原CA125不宜用于筛查，仅可与其他标志物联合检查以提高早期筛查特异性；但CA125可作为绝经后妇女卵巢癌的筛选参数，尤其是对绝经后患下腹部肿块的妇女，CA125可用于鉴别诊断良恶性卵巢包块，绝经后妇女CA125>95KU/L，阳性预测值达95%。CA125对监测治疗效果也极具临床价值，癌瘤全切以后，CA125血清浓度会下降到正常水平，一般术后CA125血清浓度下降快的其2年和5年的存活率均要比血清水平下降慢的要高。第一个化疗周期后，CA125水平如能降至原来的1/10，表明病情转归良好；首次治疗CA125水平持续升高表明预后不佳，建议每2～4个月检测一次，持续2年，然后逐渐减少检测频率。

约84%的卵巢癌患者可见HCG增高，虽不能用于诊断，但可用于卵巢癌的预后判断，血清hCG正常的卵巢癌患者5年生存率可高达80%，而血清HCG升高的患者5年生存率仅22%。

单个标志物诊断卵巢癌的特异性不高，现可组合的标志物包括：CEA、HCG、SIEX、CA125、CA199、TPA和TAG72等。对于原发性和复发的卵巢癌，最敏感的标志物是CA125、TPA和TAG72，它们的敏感性分别为65%～90%、65%～85%和60%～75%。而不同标志物的具体的敏感性及临床实用性还取决于肿瘤的组织学类型，如CA125对非粘蛋白类的卵巢癌，其敏感性最高，可达75%～90%，而TAG72则只有50%～60%，而且CA125在35%-65%的恶性基质细胞瘤和70%的胚细胞瘤病人中则也可见其血清浓度明显升高。而对粘蛋白类的卵巢癌TAG72表现出最高的敏感性，为70%。TAP相对于这两种标志物来说，敏感性就较低，所以其临床意义不大。CA125和TAG72的敏感性还与卵巢癌的分期有关，CA125在Ⅰ、Ⅱ期的敏感性较高，而且对卵巢癌的特异性可高达97%，所以它可作为绝经后妇女卵巢癌的筛选参数，尤其是对绝经后患下腹部肿瘤的妇女更有意义。