由于宫颈癌发病时程较长，目前HPV疫苗临床研究的主要研究重点是HPV感染和宫颈上皮内病变（CIN）。目前三种 HPV疫苗对于致癌性HPV 感染以及相关疾病都有显著的预防作用，包括CIN2+，阴道、外阴和肛门的上皮内瘤变。HPV疫苗的免疫活性持续时间尚在研究中；但HPV疫苗的免疫活性持续时间至少10年，且免疫效力不降低；目前尚无证据支持已接种疫苗者进行加强接种。

系统性评价和荟萃分析发现， 如果一个国家 HPV疫苗接种能够覆盖 50%以上的女孩儿和年轻女性， HPV16和 18的感染率将下降68% ，生殖道疣发生率会下降61%。根据 2012年美国疾控中心统计数据预估，如12 岁以下儿童中三剂 HPV 疫苗的覆盖率达到 80%， 将另有 5.3 万人免除宫颈癌的终身风险；如果不提高年度覆盖率， 将另有 4400例女性继续发生宫颈癌。