慢性粒细胞白血病起病缓慢，其自然病程包括无症状期、慢性期、加速期及急变期４个阶段，多数患者是在症状出现之后方去就诊并得以诊断。只有极少数患者在体检和因为其他原因检验血液时才发现血液异常，此时脾脏可能已有轻微肿大或不肿大。

慢性期常见症状包括乏力、头晕、腹部不适等，伴有基础代谢增高的相关症状，如怕热、盗汗、多汗、体重减轻、低热、心悸和精神紧张等。脾脏肿大引起腹胀、左上腹沉重感或左上腹疼痛、食后饱胀感等。

进展期 ( 包括加速期和急变期 )：加速期是慢性粒细胞白血病（CML）进入急变期的过渡阶段，也是患者病情恶化的转折点，其临床表现是一个循序渐进、逐渐加剧的过程，难以绝对分开，并且约有 20％～ 25％的患者不经加速期而直接进入急变期。进展期在临床上以不明原因的低热、乏力、食欲缺乏、盗汗、消瘦加重为特点，伴有与白细胞不成比例的脾脏迅速肿大伴压痛，淋巴结突然肿大，胸骨压痛明显和骨骼发生溶骨性变化而骨骼疼痛等体征，贫血常进行性加重，血小板进行性升高或降低。进入急变期，除伴有上述症状外还可出现全身骨痛，肝、脾、淋巴结肿大，髓外浸润表现。严重的中性粒细胞缺乏常导致难以控制的细菌、真菌感染；严重的血小板缺乏引起出血趋势加重，甚至发生脑出血而死亡。

慢性粒细胞白血病最突出的表现为脾大相关的腹胀、食欲减退以及乏力消瘦等。胸骨压痛也是常见的体征，通常局限于胸骨体，因触痛而拒绝按压。面色苍白也是本病特征性改变，早期可不明显，随病情加重而显著。