常见的化疗药物有：5- 氟尿嘧啶、顺铂、奥沙利铂、卡培他滨、吉西他滨及伊立替康等。

化疗最常见的不良反应是胃肠道反应，患者出现恶心、呕吐、腹痛、腹泻、便秘等，也可以有口腔黏膜或消化道黏膜溃疡导致的便血等。骨髓抑制也是常见的不良反应，其中以白细胞减少最常见，其次是血小板减少。如果没有明显的消化道出血，贫血一般不会立即出现。标准剂量下的化疗可以出现肝脏功能和肾脏功能的损害。一般来说化疗药物可以对卵巢和辜丸的功能有一定程度的影响，从而影响生殖功能。患者也可以出现脱发等情况。化疗药物种类很多，不同化疗药物对身体各脏器的毒性作用是有差别的。