乳腺癌必须做分子分型。传统的肿瘤解剖病理分期对乳腺癌的诊断和治疗起到重要的作用，但乳腺癌是一种高度异质性的肿瘤，临床上发现组织学类型和病理分期相同的患者，在临床表现、治疗反应和疾病预后方面有明显的差异，主要原因在于存在不同的分子表型，不同分子分型的乳腺癌的治疗方案和生存预后截然不同。

目前最常用的分子分型是基于免疫组化检测结果进行的分型，通常根据雌激素受体（ER）、孕激素受体（PR）、人表皮生长因子受体-2（HER-2）及Ki-67表达水平将乳腺癌分成4种分子亚型：Luminal A型（管腔A型），LuminalB型（管腔B型），HER-2过表达型，三阴型。多基因表达谱分型如Oncotype DX和MammaPrint，因操作复杂、费用昂贵、标准不统一，目前基于中国人群基因检测数据较少，国内缺乏相应的行业标准与共识，目前未在临床中广泛应用。