出现以下情况可选择干细胞移植：新诊断的慢性粒细胞白血病儿童患者；加速期或急变期的患者；伴有 T315I 突变的慢性期患者；对二代酪氨酸激酶抑制剂治疗反应欠佳、失败或不耐受者的所有患者（更换二代酪氨酸激酶抑制剂 6 月后仍未获得主要遗传学反应者，其 12 月获得主要细胞遗传学反应以及长生存的可能性明显降低，应尽早考虑 SCT）；慢性期患者 Sokal 评分高危而移植 EBMT 风险积分≤ 2，如果有同胞 HLA 相合供者，可以选择一线 allo-HSCT 治疗。对于 HLA 不相合者不推荐 Allo-SCT，但因经济原因或者患者强烈意愿选择移植时可考虑移植。