肿瘤的发生与病原体的感染有关，特别是与病毒的感染关系更为密切。目前研究最广泛的就是乙肝病毒、人乳头状瘤病毒（HPV）和EB病毒对表观遗传的改变。如EB病毒和人乳头瘤病毒的感染与人类肿瘤发生联系紧密。EB病毒是第一个确认的与人类癌症相关的病毒，与鼻咽癌、伯基特淋巴瘤、霍奇金病有关，感染可引起淋巴瘤、鼻咽癌、胃癌的发生。HPV与宫颈癌的发生有关，不同类型的HPV与宫颈癌的恶性表现有关。乙型肝炎病毒、丙型肝炎病毒、人类免疫缺陷病毒与肿瘤的发生也有一定的关系。携带乙型肝炎病毒的人群患肝细胞癌的风险大约是正常人的100倍。幽门螺杆菌，革兰氏阴性菌，1991年被发现与胃癌有关。在1994年，国际癌症研究协会和世界卫生组织宣布幽门螺杆菌是一级致癌物质，目前65%的胃癌和全球5.5%的癌症均是由幽门螺杆菌引起的。当然还有一些其他的病毒与肿瘤的发生风险还要研究中，因此增强人体免疫力注重个人卫生、养成良好的生活习惯对于预防肿瘤的发生十分必要。