普通的体检无法完全代替肿瘤标志物检测，甚至有可能错过最佳的肿瘤早期诊断和治疗的机会。因为普通的健康检查的对象是心、肝、肾功能、血糖、血脂、血压等，掌握人体的一般状况，对高血压、糖尿病等慢性基础病变有较好的筛查作用，但不能及时发现早期癌症。我们知道，早期诊断是治愈肿瘤的关键，而有些肿瘤标志物的升高往往早于临床症状的出现。因此肿瘤标志物检测对毫无症状的健康人群进行的医学检查，除了可以筛查早期癌症外，还会检查、评估一些增加癌症发病概率的机能变化，有助于早期发现肿瘤迹象，早诊断、早治疗，从而提高疗效。肿瘤标志物有利于区分肿瘤的性质及生物特性当患者B超或胸片检查发现体内肿块占位，可以通过检测血中的情况，来帮助鉴别是良性还是恶性。当患者有乙肝病史，体检查出肿瘤标志物甲胎蛋白（AFP）轻度升高，随访AFP仍每月持续升高，可以高度怀疑为原发性肝癌，建议行进一步影像学检查或穿刺病理学检查。此外，肿瘤标志物初次检测的基础水平，亦间接反映了肿瘤的生物学特性，基础指标越高，说明肿瘤负荷越大，发展迅速，分泌到血中的肿瘤标志物愈多，预后越差。有利于疗效观察和判断预后这是临床肿瘤学家最青睐的的应用价值。肿瘤患者经治疗后，肿瘤标志物的升降与患者的疗效和预后有良好的相关性。手术前肿瘤标志物升高，术后下降，说明手术成功；手术后下降，一段时间后又持续升高，提示肿瘤的复发或转移。而且肿瘤标志物特别敏感，这种提示往往早于临床症状出现前数个月。所以医生往往要求患者定期随访肿瘤标志物的变化情况，以便及时了解患者的病情发展，及早采取干预措施。同样的，肿瘤患者化疗后肿瘤标志物下降说明化疗有效；治疗后肿瘤标志物继续升高，则应更换化疗方案，如果更换化疗方案后肿瘤标志物仍持续升高，往往说明肿瘤对常规化疗药物已经产生耐药，预示着肿瘤的复发或转移。