有研究报道经射频消融治疗的肝癌患者死亡率为 0.3％，总的并发症率为 7.6％。主要并发症有：

①胃肠道穿孔：发生率约0.3％，常发生在既往有右上腹手术史、肿瘤距肝包膜在 1 厘米以内且靠近胃肠道的患者。

②腹腔出血：发生率约 0.5％，出血易发生于肝硬化等患者，来源于消融区、肝转移灶、针道、肝内血肿破裂等。

③肝脓肿：发生率约 0.3％，常发生于伴有糖尿病或胆道中有气体者。

④肝功能衰竭：发生率小于 0.1％，往往由于患者术中多次接受射频治疗、为追求彻底灭活肿瘤或中心血管血栓形成等引起。

⑤针道肿瘤种植：发生率约 0.5％，大部分出现在术后 4 ～ 18 个月，易发生在肿瘤位置表浅致灼烧针道不便、肿瘤较深而行针刺活检、AFP 基础水平高及低分化的患者。次要并发症及副反应有：疼痛、消融术后综合征（表现与流感相似，如低热、全身乏力等。如果消融范围很大，症状可在术后很快出现，有时会持续 2 ～ 3 周，甚至高热、昏睡）、皮肤灼伤等。