目前，大约 90％的患者可以选择保留肢体的肿瘤切除手术。手术分三个步骤：切除肿瘤、骨骼重建、肌肉和软组织覆盖。

辅助化疗在骨肉瘤治疗中占有重要地位。单独手术治疗的 5年生存率只有 20％，而联合化疗可以把这一数值提高到 75％。目前大多数医院都开展了新辅助化疗（术前化疗），这样做的好处很多，例如术前化疗可以消灭肉眼看不到的微小转移灶；通过术前化疗使肿瘤变小，更容易被切除掉。切除肿瘤后还可以从肿瘤组织的坏死程度来判断肿瘤对化疗的敏感性，进而决定术后化疗的方案。

骨肉瘤对放疗一般不敏感，但如果肿瘤无法切除或者虽然做了手术但没有切除干净，这时可以采用姑息性的放疗，患者也可能从中获益。