慢性粒细胞白血病的发病原因是基因突变。对于大多数诊断为慢性粒细胞白血病的患者来说，没有发现导致他们患病的明确风险因素。有研究显示慢性粒细胞白血病可能与下列因素相关：

(1) 环境因素影响。与接触大剂量放射性照射有某种联系（如日本原子弹爆炸中幸存者可证实这点）。然而是否接受放射治疗就会导致慢性粒细胞白血病发生，这点现在还存在争议，因为有些接受大剂量放射性照射者并不发生慢性粒细胞白血病，很多慢 性粒细胞白血病患者亦没有大剂量放射性照射史。

(2) 病毒感染。

(3) 化学药物及制剂的接触，例如：苯和一些有害烟雾等。慢性粒细胞白血病的发生与遗传因素相关的证据极少。慢性粒细胞白血病是一个后天获得性疾病，而非遗传性疾病。慢性粒细胞白血病患者的后代发病率并不比普通人群高，而且在同卵双生中，慢性粒细胞白血病的发病并无直接联系。慢性粒细胞白血病和感染之间也没有明确的联系。慢性粒细胞白血病不具有传染性。